吳鳳科技大學創設應用數位媒體系，以人文與藝術的基礎教育為本體，由思考方式與創意啟發的培養結合各類科技媒體作為傳達意念的表現，同時以共同實現的創作媒體為目標，將所需要的各專業領域巧妙的結合，並組織科技媒體學程。透過各種實驗參與的過程中，改造學生沿襲技職體系教育的思考模式，使學生能在技術的養成之外，更能激發自己本身的原創性，思考培養超越自我創作精神，並刺激相關業界的發展。

        為因應產業需才孔急，應用數位媒體系計畫建構完整的多媒體應用發展環境，培育媒體企劃設計與數位影音製作的創新人才、多媒體電腦動畫、遊戲設計與相關媒體整合應用的專業人才，跨入數位影音及2D、3D動畫領域，並積極發展該專業領域在網際網路或互動式傳播等各方面的應用，引領學生成為兼具藝術文化素養與電腦尖端科技技能的新媒體專業工作者。

        因應數位媒體產業興起，以及雲嘉南地區產業數位化需求，並為區域產業培養各類全方位數位媒體設計、行銷與應用人才，本校於98年度即投入數位媒體與U化網路環境建置計畫，將投資集中於建立整體校園的數位媒體與資訊無所不在的環境，並於98學年度籌設「應用數位媒體系」大學部及碩士在職專班。本系於99學年度起招收大學部日四技一班(招生名額為45人)及碩士在職專班一班(招生名額為20人)，日間部四技並於100學年度起招收日四技二班。此外，夜四技進修部於102及103學年度連續招生兩屆，然而由於少子化因數，夜間部四技學生來源不足，故於104學年度停止夜四技招生。因此，本系自104學年度起招生策略，以維持本系永續經營之運作規模，每年招收碩士在職專班一班及大學部日四技二班的招生規模為目標。

        有鑑於產業需求，勞動部於104學年通過本系開辦雙軌旗艦-商品設計專班1班，至今開辦長達8年時間。本系於108學年度招收假日班二技生1班；在110學年招收新南向越南籍數位設計國際專班1班；於112學年經教育部審核通過開辦產學攜手專班(延續雙軌旗艦班)1班。經過教育部核准，本系於113學年度更名為數位科技與媒體設計系，以數位科技與媒體設計為兩大特色主軸。